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基因组学数据库 Genome database
TCGA数据库
关键词Keywords:TCGA;癌症;基因表达
简介Description:由美国国立卫生研究院国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所共同合作的一个项目,旨在通过基因手段全面表征预后不良,解析癌症发生的分子互作、肿瘤的亚型和治疗的靶点等。
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基因组学数据库 Genome database
DAVID数据库
关键词Keywords:DAVID;基因功能分类;功能注释
简介Description:主要进行基因功能和通路注释等功能分析,包括功能注释、基因功能分类、基因ID转换等。
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基因组学数据库 Genome database
COSMIC数据库
关键词Keywords:COSMIC;数据库;癌症
简介Description:提供了与癌症相关体细胞突变的信息,记录的体细胞突变比较详细,可以追溯到文献出处,还能将样本信息、涉及的癌症类型等进行统计。
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基因组学数据库 Genome database
ICGC数据库
关键词Keywords:ICGC;GO注释;基因通路
简介Description:可搜索到自己感兴趣的基因在患者样本中的突变情况,还会提供基因的基本信息和一些注释,包括该基因参与的通路以及相应的GO注释等。
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基因组学数据库 Genome database
GDB数据库
关键词Keywords:GDB;基因组图谱;序列变异
简介Description:基因组数据库(GDB)为人类基因组计划(HGP)保存和处理基因组图谱数据。GDB的目标是构建关于人类基因组的百科全书,除了构建基因组图谱之外,还开发了描述序列水平的基因组内容的方法,包括序列变异和其它对功能和表型的描述。
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基因组学数据库 Genome database
DDBJ数据库
关键词Keywords:DDBJ;基因组;数据库
简介Description:日本DNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库,与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。可以使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。可以用Sequin软件向该数据库提交序列。