比对工具

比对工具 Comparison tools
Cellar

Cellar实现一套全面方法，包括现有和新的方法，并涵盖了细胞类型分配过程中涉及的所有步骤。这些方法包括降维和表示、聚类、基于参考的比对、差异表达基因的识别、与功能和标记集的交叉、管理会话和导出结果的工具，以及同时分析和比较两个数据集的双重模态。
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ACT：Artemis比较工具

Artemis比较工具（ACT）允许交互式可视化完整基因组序列和相关注释之间的比较。比较数据可以用几个不同的程序生成; 基因组DNA序列之间的BLASTN，TBLASTX或Mummer比较，或通过蛋白质组之间的相互FASTA比较产生的直向同源表。可以从整个基因组到碱基对差异的任何水平鉴定相似性，插入和重排的区域。ACT使用Artemis组件显示序列，因此继承了强大的搜索和分析工具。ACT是Artemis发行版的一部分，同样是开源的，用Java编写，可以在任何支持Java的平台上运行，包括UNIX，Macintosh和Windows。
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CLUSTAL OMEGA

DNA、RNA、蛋白的多序列比对
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