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蛋白组学数据库 Proteomics database
简介Description:Proteopedia是一种用于蛋白质和生物分子结构和功能的协作虚拟3D网络资源。
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蛋白组学数据库 Proteomics database
简介Description:InterPro是一种资源,通过将蛋白质序列分类为家族并预测结构域和重要位点的存在来提供蛋白质序列的功能分析。为了以这种方式对蛋白质进行分类,InterPro使用由组成InterPro联盟的几个不同数据库提供的预测模型。
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蛋白组学数据库 Proteomics database
PSP数据库
关键词Keywords:蛋白组学;生物功能;蛋白质结构
简介Description:PhosphoSitePlus (PSP),从PhosphoSite重新设计而成,是研究实验中观察到一个开放的,动态的,连续策划和高度交互的系统生物学资源翻译后修饰中的生物学过程的调节。PhosphoSite 仅限于磷酸化。PSP虽然仍提供蛋白质磷酸化的全面覆盖,但现在包括其他常用的PTM,包括乙酰化,甲基化,泛素化和O-糖基化。
PSP包括关于特定修饰位点的拓扑结构,生物功能和调节意义的关键结构和功能信息,以及在生物调节,疾病,组织,亚细胞定位,蛋白质结构域,序列,基序的背景下挖掘和解释该数据的强大工具等
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蛋白组学数据库 Proteomics database
UniProtKB数据库
关键词Keywords:蛋白质功能;氨基酸序列;蛋白质信息注释
简介Description:UniProt知识库(UniProtKB)是收集蛋白质功能信息的中心枢纽,具有准确,一致和丰富的注释。除了获得每个UniProtKB条目必需的核心数据(主要是氨基酸序列,蛋白质名称或描述,分类学数据和引用信息)之外,还添加了尽可能多的注释信息。这包括广泛接受的生物本体,分类和交叉参考,以及以实验和计算数据的证据归属形式的注释质量的明确指示。
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蛋白组学数据库 Proteomics database
SCOP2数据库
关键词Keywords:蛋白质;蛋白质结构;蛋白质分析
简介Description:SCOP2是蛋白质结构分类(SCOP)的后继者。与SCOP类似,SCOP2的主要焦点是在结构上表征并沉积在PDB中的蛋白质。蛋白质根据其结构和进化关系进行组织,但与SCOP相比,这些关系不是简单的树状层次结构,而是形成复杂的节点网络。每个节点代表特定类型的关系,并以蛋白质结构和序列的区域为例。
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蛋白组学数据库 Proteomics database
PRINTS数据库
关键词Keywords:蛋白质诊断;蛋白质结构;蛋白质指纹
简介Description:RINTS是蛋白质指纹的概要。指纹是一组用于表征蛋白质家族的保守基序; 通过SWISS-PROT / TrEMBL复合材料的迭代扫描来改进其诊断能力 。通常,图案不重叠,但沿着序列分开,尽管它们在3D空间中可能是连续的。指纹可以比单个基序更灵活,更有力地编码蛋白质折叠和功能,完全诊断效力源自主题邻居提供的相互背景。