RT-SHIV rt基因单拷贝PCR扩增方法的建立及初步应用

文献名称Document name	RT-SHIV rt基因单拷贝PCR扩增方法的建立及初步应用
编号Document number
PMIDPMID number
作者Author	鞠斌, 王卫, 丛喆, 姚南, 陈霆, 杜文达, 苏爱华, 高锡强, 魏强
中文摘要Abstract in Chinese	目的建立RT-SHIV病毒全长rt基因单拷贝PCR扩增方法,用于HIV-1 rt基因体内遗传与变异研究.方法 Oligo软件设计RT-SHIV rt基因特异性扩增引物,梯度稀释方法进行特异性和灵敏度筛选,进而优化退火温度和PCR反应最佳循环数等条件,建立rt基因PCR扩增方法;在此基础上将模板进行有限稀释,摸索rt基因单拷贝PCR扩增条件;使用该方法扩增感染猴体内RT-SHIV病毒rt基因,BioEdit软件进行基因序列分析.结果筛选得到一组巢式PCR引物,成功建立了RT-SHIV rt基因PCR扩增方法;当模板浓度为100 copies/μL时,扩增产物为单拷贝序列;测序结果显示RT-SHIV感染猴d266和d294血浆样本分别存在1处和6处氨基酸突变.结论本研究建立的全长rt基因单拷贝PCR扩增方法特异性好、灵敏度高、重复性强,可以应用于各类RT-SHIV病毒的全长rt基因分析.
英文摘要Abstract in English
关键词Key word	RT-SHIV, 单拷贝PCR, rt基因
发表杂志Journal	中国比较医学杂志
发表年份Year	2012
录入/更新时间Date	2021.7.1